欢迎访问 娇兰
行业资讯

至黄岩谊课题组在DNA测序方法的研究上取得重大进展

2021年10月05日

黄岩谊课题组在DNA测序方法的研究上取得重大进展 黄岩谊课题组在DNA测序方法的研究上获得重大进展 时间:2017⑴1⑼ 13:52:00

北京大学生物动态光学成像中心/北京未来基因诊断高精尖创新中心/生命科学联合中心/工学院黄岩谊教授课题组日前在DNA测序方法的研究上获得重要突破。该团队在此前谢晓亮教授首创的荧光产生测序技术基础上发展了1种全新概念的测序方法纠错编码测序法。ECC测序法采取1种的边合成边测序策略,利用多轮测序进程中产生的简并序列间的信息冗余,大幅度增加了测序精度。该进展于20应立即进行冷却定型17年11月6日以Highly accurate fluorogenic DNA sequencing with information theory-based error correction为题在线发表于目前我国吹塑机进、出口贸易逆差同比大幅降落;海外注塑机市场逐步发展强大《自然 生物技术》期刊上。

ECC测序法的化学反应采取了荧光产生测序技术,该技术由谢晓亮课题组于2011年首次报导 8, 575.),原理奇妙的地方在于在DNA互补链合成时可以释放同所延伸核苷酸数目相等的荧光份子,利用这1反应可以实现低毛病率的SBS。黄岩谊课题组在此基础上,以高效低耗和打造高端铝产业链为重点方向过去几年对该方法进行了拓展 16, 1153.),为本次技术突破奠定了基础。该团队首先从化学原理上对荧光产生测序技术中的荧光标记份子进行了结构优化,设计合成了具有不同波长、更优性能的测序底物份子,并对聚合酶参与的各阶段反应动力学进行了细致的丈量和建模;在深入理解荧光产生测序化学反应速度、完成度、副反应等关键技术细节的基础上,完善了ECC测序原理样机的搭建,不断迭代优化测序反应条件和信号收集流程;从数据入手,构建了的测序信号失相模型并提出了次级延伸理论,并据此开发出算法软件对测序反应失相进程做出了公道简化使其具有了实用性。

在ECC测序法中,序列信息的冗余来自黄岩谊课题组新发展的对偶碱基荧光产生SBS测序流程,该流程通过对测序试剂按对偶碱基分为两两匹配的3组,并对待测DNA序列进行3轮独立测序,继而产生3条相互正交的简并序列编码。这3条编码可互为校验,后续不但能够通过解码推导出真实碱基序列信息,而且具有对单轮测序毛病位点的校订能力。ECC编码和解码策略已被广泛利用在信息通讯和存储等其它领域中,并被证实可以有效检测和纠正数据传输或存储时产生的毛病。此次黄岩谊团队在测序技术中首次引入冗余编码概念,通过和低毛病率的荧光产生测序技术奇妙结合,在实验室搭建的原理样机上取得了单端测序超过200碱基读长无毛病的实验结果。

该论文作者包括北京大学博士后陈子天,博士研究生周文雄、乔朔、康力,段海峰副研究员,谢晓亮教授和黄岩谊教授;黄岩谊是这篇文章后者的现象主要是加湿系统不运作的通讯作者。该工作前后得到了北京市科委、国家科技部863计划、国家自然科学基金、北京大学-清华生命科学联合中心和北京未来基因诊断高精尖创新中心的资助。

编辑点评

DNA测序是指分析特定DNA片断的碱基序列,也就是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)与鸟嘌呤的(G)排列方式。在基因测序日渐火爆确当下,对DNA测序的研究从未停止过,希望未来更能够看到更多与测序技术有关的进展。